أنشئت الكلية في عام 1993م بمدينة المناقل حاضرة محلية المناقل – ولاية الجزيرة. تم اختيار محلية المناقل مقراً للكلية لأنها تزخر بكل أنواع الثروة الحيوانية بما فيها إنتاج الدواجن ، كما أنها تُعَدَّ منطقة رعي ومعبر لمرور الحيوانات من ولايات غرب السودان إلي أواسطه . وجود هذه الكلية في تلك المنطقة له دور مهم لإدخال الحيوان في الدورة الزراعية في مشروع الجزيرة . تسهم الكلية في تدريب الرعاة والمزارعين عن طريق البرامج الإرشادية . تخرجت الدفعة الأولي (الدفعة 16) في العام 1999م.